交通科学与工程学院党总支下设教工物流管理党支部、教工无人机工程党支部、教工工业工程党支部、教工交通工程党支部、教工土木工程党支部5个教工党支部,及学生2018级党支部、学生2019级党支部、学生2020级党支部、学生2021级党支部4个学生党支部。